Michaela Šojdrová úspěšně kandidovala v roce 2014 za stranu KDU-ČSL, která se v Evropském parlamentu řadí k frakci EPP. Ve volbách 2019 svůj mandát obhájila ze třetího místa. V předchozím europarlamentu byla členkou výboru pro kulturu a vzdělávání (CULT) a výboru pro práva žen a rovnost pohlaví (FEMM).